De term link heeft verschillende toepassingen: in dit geval zijn we geïnteresseerd in het verwijzen naar de betekenis ervan als een unie of een koppeling tussen verschillende elementen. Peptide daarentegen is verwant aan peptiden : de moleculen die worden gevormd door een covalente vereniging van aminozuren (organische stoffen waarvan de moleculaire samenstelling een carboxylgroep en een aminogroep heeft).

Het wordt peptidebinding genoemd voor de chemische binding die tot stand komt tussen de carboxylgroep van een aminozuur en de aminogroep van een ander aminozuur . Dit soort koppeling, waarbij een watermolecuul verloren gaat, maakt de vorming van de hiervoor genoemde peptiden en eiwitten mogelijk .

Na binding van een aminogroep ( -NH2 ) en een carboxylgroep ( -COOH ) met verlies van een watermolecuul, wordt een CO-NH- binding tot stand gebracht. De ontwikkeling van deze link heeft altijd de bijdrage van energie nodig ; Op zijn beurt, wanneer de peptidebinding wordt verbroken, treedt energie vrij.

Het breken van een peptidebinding kan plaatsvinden door middel van hydrolyse : dit wordt de splitsing genoemd die een molecule registreert door water. Hydrolyse, in de natuurlijke omgeving, gebeurt heel langzaam, hoewel het mogelijk is om het proces te versnellen met behulp van verschillende technieken .

In aanwezigheid van water kan een peptidebinding worden gebroken met een hoeveelheid vrije energie die ongeveer 8-16 kilojoule / mol is (wat overeenkomt met 2-4 kcal / mol). De kilojoule- eenheid per mol, die kan worden gesymboliseerd als kJ / mol, wordt erkend door het internationale systeem van eenheden ( SI ) en komt overeen met de relatie tussen energie en de hoeveelheid materie : energie wordt uitgedrukt in kilojoules en materie wordt gemeten in mollen

De kilojoules zijn niet meer dan duizenden joules, een andere meeteenheid die wordt herkend door het internationale systeem, waarvan de oorspronkelijke naam joule is en wordt gebruikt voor het meten van warmte, werk en energie. In technisch opzicht is de definitie "de hoeveelheid werk uitgevoerd door een Newton met een constante kracht langs een meter in de richting van de kracht". De mol eenheid, aan de andere kant, wordt gebruikt om de hoeveelheid van een bepaalde stof te meten, en maakt deel uit van de zeven fundamentele fysieke grootten van de SI.

Om de hydrolyse van een peptidebinding te versnellen, die in de natuur meer dan een millennium kan duren, kunnen wetenschappers een van de volgende methoden kiezen :

* zure hydrolyse : dit wordt bereikt door het eiwit lange tijd in kokend water te laten met oplossingen van een sterk zuur type (H2SO4 en HCI). Deze weg bereikt de volledige vernietiging van tryptofaan en een deel van threonine en serine;

* basische hydrolyse : het wordt gewoonlijk uitgevoerd met behulp van BaOH of NaOH en vernietigt de aminozuren die in de vorige methode zijn genoemd niet;

* enzymatische hydrolyse : bij levende wezens is deze manier van afbreken van de peptidebindingen de normaalste. In dit geval doen proteolytische enzymen die langzaam en vaak werken hun werk niet af, maar noch de vernietiging van aminozuren noch racemisatie (wanneer een optisch actieve verbinding racemisch wordt) treedt op. Dit type hydrolyse is zeer specifiek;

* hydrolyse door temperatuur : als de omstandigheden normaal zijn, worden de peptidebindingen niet vernietigd, maar het eiwit kan worden gedenatureerd (dat wil zeggen dat de secundaire, tertiaire en quaternaire structuren ervan worden afgebroken). Aan de andere kant, als een temperatuur hoger dan 110 ° gedurende 48 uur wordt toegepast, is het mogelijk om de koppelingen te vernietigen.

Opgemerkt moet worden dat de peptideband in het algemeen wordt weergegeven als een enkele binding . In elk geval heeft het verschillende functies die het dicht bij een dubbele link maken. Dat is de reden waarom specialisten meestal vermelden dat een peptidebinding eigenschappen heeft die hem halverwege tussen een enkele link en een dubbele link plaatsen.